ネコには外部寄生虫としてネコノミやヒゼンダニ、マダニ等が寄生しています。飼いネコであればペットカラー(駆除剤染込ませた首輪)を付けたり、動物病院を受診することで管理できますが、野良ネコの場合は忌避処理をして近づけないことが第一です。
ネコノミの駆除薬剤はホームセンター、ドラッグストアで容易に入手できます。説明をよく読み用法・用量を守ってお使い下さい。室内では燻煙剤等の利用が有効です。自家処理したが効果がない場合は、専門業者にご相談ください。当協会ホームページにネコノミについて説明があります。ご覧ください。

最近、野良ネコを保護しようとした女性がネコについたマダニが媒介する「重症熱性血小板減少症候群(SFTS)」に感染し死亡した例があります。一般にマダニは野性動物に寄生し発症例はありますが野良ネコによるものは初めてです。
他にもネコに由来する感染症には以下のものがあります。咬まれる、引掻かれる、舐められることでネコの体液や糞便に存在する菌を知らずに口にしてしまうことにより感染します。野良ネコに触れた後は手洗いが重要です。なお、ネコエイズは人には感染しません。